Вопрос
Я находился несколько дней на больничном, а в это время завод, где я работаю отправил всех рабочих в отпуск.
Будут ли мне оплачены дни болезни?

Ответ
Из вопроса я понял что ваше предприятие отправило работников в отпуск.
Если в вашем вопросе речь идёт об оплачиваемом отпуске в счёт годового, то в период вашей болезни вам должны быть оплачен именно больничный, а не отпускные. Период вашей болезни не может считаться отпуском. Таким образом у вас должны сохраниться отпускные дни которые могли бы быть «израсходованы» работодателем в период вашей болезни.
Ваш больничный лист должен быть оплачен.
Вам следует незамедлительно предъявить работодателю свой больничный лист и требовать его оплаты.
Если в вашем вопросе речь идёт о так называемом «отпуске за свой счёт» или «отпуске без оплаты», то подобные действия со стороны работодателя могут иметь законную силу только с согласия работника.